A doua zi după evenimentele din 7 aprilie 2009, Procuratura Generală a deschis un dosar penal pentru tentativă de răsturnare a puterii, lovitură de stat şi uzurpare a puterii. Mai mulţi lideri ai opoziţiei de atunci au fost acuzaţi de organizarea dezordinilor din centrul Capitalei şi au fost audiaţi de procurori. După venirea la puterea a Alianţei pentru Integrare Europeană, rolurile s-au schimbat.

După protestele din aprilie anul trecut, Vladimir Voronin a declarat că liderii opoziţiei de atunci trebuie să răspundă în faţa legii. În iunie 2009, Procuratura a deschis un dosar penal pe numele primarului de Chişinău, Dorin Chirtoacă. El a fost acuzat de tentativă de preluare a puterii şi organizarea dezordinilor din 6-7 aprilie. După venirea la putere a AIE, au fost retrase toate acuzaţiile împotriva liderilor opoziţiei. În noiembrie, Chirtoacă a fost scos de sub urmărire penală.

În acelaşi timp, la Procuratura Generală au fost citaţi foştii reprezentanţi ai guvernării comuniste. În decembrie 2009, au fost deschise dosare penale pe numele fostului ministru de Interne, Gheorghe Papuc, şi a fostului comisar al Chişinăului, Vladimir Botnari. Ei au fost acuzaţi de neglijenţă în serviciu, soldată cu moartea lui Valeriu Boboc. În timpul audierilor, Papuc a declarat că toate acţiunile poliţiei din luna aprilie au fost coordonate cu fostul preşedinte Voronin.

Peste 1.500 de persoane au fost audiate în cadrul investigaţiilor evenimentelor din aprilie 2009. Printre acestea se numără foşti demnitari de stat, politicieni şi funcţionari din structurile de forţă. Până acum, Procuratura Generală a deschis peste 100 de dosare. Jumătate dintre ele vizează cazuri de tortură.