De pe 1 ianuarie 2013, universităţile din Moldova au trecut la autogestiune. Potrivit noului regulament, instituţiile de învăţământ superior de stat îşi pot cheltui banii proprii, dar şi cei alocaţi din buget, după bunul plac.

Documentul privind autonomia financiară a universităţilor a fost aprobat de Guvern în decembrie 2012. Autorii proiectului au propus ca mecanismul să fie testat timp de doi ani. În aceasta perioadă, se va simula formula de alocare a mijloacelor băneşti per student, în funcţie de specializare, durata studiilor şi alţi factori. Acest calcul va permite acoperirea costurilor de studii pentru fiecare student în parte.

De asemenea, regulamentul mai prevede că atât banii alocaţi de la bugetul de stat, cât şi cei acumulaţi din plata taxelor de studii, arendă sau sponsorizări, sunt depuşi pe un cont bancar. Astfel, instituţia de învăţământ superior de stat îşi planifică independent cheltuielile.

Activitatea financiară a universităţilor este monitorizată de un Consiliu de Dezvoltare Instituţională şi o Comisie de Etică. Sub incidenţa proiectului au căzut 16 universităţi de stat. Excepţie fac instituţiile subordonate Ministerului Afacerilor Interne, Ministerului Apărării şi Institutului de Ştiinţe ale Educaţiei.