Rusia este principala piaţă de desfacere pentru vinurile moldoveneşti. Însă pe 27 martie 2006, serviciul rus fitosanitar Rospotrebnadzor a impus interdicţii la importul producţiei vinicole din Moldova. Autorităţile ruse şi-au motivat gestul prin faptul că vinurile din Republica Moldova nu corespund normelor de calitate.

Experţii ruşi susţineau că au depistat în vinurile şi divinurile moldoveneşti o cantitate mare de metale grele şi pesticide. Interdicţia pentru vinurile din Republica Moldova a redus cu 46 la sută nivelul producţiei în cel mai important sector al economiei. Asta pentru că 80 la sută din exporturile moldoveneşti aveau ca destinaţie Federaţia Rusă. Un an de interdicţii a dus la pierderi totale de aproximativ 180 de milioane de dolari. Exportul producţiei vinicole în Rusia a fost reluat pe 1 noiembrie 2007. Dar revenirea vinurilor moldoveneşti pe piaţa rusă nu a fost una triumfală, deoarece locul lor a fost luat de vinurile din alte ţări.

Consecinţele crizei sunt resimţite şi acum. În prezent, în depozitele din ţară sunt stocate 37 de milioane de decalitri de vin, provenite din recoltele anilor trecuţi şi estimate la 300 de milioane de dolari. Datoriile vinificatorilor pentru materia primă au ajuns la 17,2 milioane de dolari, iar 50 de întreprinderi din 130 au falimentat.

Pentru a susţine cât de cât producătorii autohtoni, Parlamentul de la Chişinău a adoptat, la sfârşitul lui septembrie 2009, un set de amendamente la Legea cu privire la viţa-de-vie şi vin, iar noile prevederi permit vânzarea vinului în vrac.