Formaţia Rapid Ghidighici a apărut pe scena fotbalistică din Moldova în urmă cu şapte ani! În acest timp, echipa a reuşit să joace atât în Divizia Naţională, cât şi în Divizia A, să provoace mai multe scandaluri şi să ocupă un loc în prima jumătate a campionatului. Cea mai mare performanţă a fost realizată, însă, în acest sezon. Rapid s-a calificat în premieră în finala Cupei Moldovei-Orange.

Ghidighici este o localitate de la periferia Capitalei, unde fotbalul a fost mereu la loc de cinste. În urmă cu 40 de ani, în ligile inferioare ale campionatului juca şi formaţia Rapid Ghidichici, care însă nu a înregistrat performanţe notabile. În 2005, Rapid a reînviat. Câteva persoane, printre care Ion Poalelungi, Viorel Guţan şi Alexei Ganja, în frunte cu omul de afaceri Victor Ostap, au fondat clubul profesionist Rapid.

În 2007, formaţia din Ghidighici a promovat în Divizia Naţională, după ce a terminat pe primul loc campionatul în Divizia A. Însă sezonul de debut în liga superioară a fost incomplet. După ultima etapă din tur, preşedintele clubului, Ostap, a decis să-şi retragă echipa din campionat, în semn de protest faţă de arbitrajul moldovenesc. Totuşi, în sezonul 2008-2009, Rapid a fuzionat cu CSCA Chişinău şi s-a înscris din nou în Divizia Naţională.

Cel mai bun rezultat în campionat pentru Rapid a fost înregistrat în sezonul 2009-2010, când a ocupat locul şase în clasamentul final. Cea mai bună performanţă din istorie a devenit, însă, calificarea din acest an în finala Cupei Moldovei-Orange.